在流速較慢、水位較深、生態(tài)疏浚不便或斷頭河、黑臭河等水體，通過(guò)培養(yǎng)或投加具有特定功能的微生物菌種，可調(diào)控水體微生物群落，有效降解污染水體中的沉積物和造成黑臭的有機(jī)物質(zhì)、氨氮等富營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，去除黑臭，增強(qiáng)水體自凈能力。

微生物強(qiáng)化一般以硝化細(xì)菌、反硝化細(xì)菌以及有機(jī)物降解的光合細(xì)菌為主，具體菌種和投放計(jì)量還需根據(jù)河湖污染情況進(jìn)行判斷。